Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F6O75461 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms