Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PPFIA3O75145 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA3O75145 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms