Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms