Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms