Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms