Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF879B4DU55 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF879B4DU55 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms