Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms