Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPG2Q9UBF2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms