Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC39A9Q9NUM3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms