Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms