Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3C3Q8NEB9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms