Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms