Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms