Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL24A1Q17RW2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms