Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDKN3Q16667 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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