Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF11Q15544 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms