Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SMCO1Q147U7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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