Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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PKP1Q13835 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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