Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LAMB3Q13751 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMB3Q13751 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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