Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL3Q13618 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms