Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 DUXAP7-201ENST00000431038 689 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MKRN4PQ13434 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms