Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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