Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBRQ0VD83 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms