Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPAL4Q0D2K0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms