Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUCB1Q02818 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms