Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms