Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXC5Q00444 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms