Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
HERVK_113P61574 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms