Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP9P55211 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms