Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTGER4P35408 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER4P35408 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms