Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA2P29317 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA2P29317 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms