Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMA4P25789 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms