Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNB1P20700 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms