Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DESP17661 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DESP17661 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DESP17661 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DESP17661 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms