Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGB4P16144 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms