Protein–RNA interactions for Protein: P0DMV2

CT45A9, Cancer/testis antigen family 45 member A9, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT45A9P0DMV2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CT45A9P0DMV2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms