Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DENRO43583 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DENRO43583 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DENRO43583 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms