Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TRAPPC1Q9Y5R8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms