Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMPQ9Y244 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POMPQ9Y244 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms