Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF8Q9UPP1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF8Q9UPP1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms