Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CNTNAP2Q9UHC6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTNAP2Q9UHC6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms