Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGN4

CD300A, CMRF35-like molecule 8, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300AQ9UGN4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD300AQ9UGN4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms