Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALCOCO1Q9P1Z2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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