Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB6BQ9NRW1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms