Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FOXQ1Q9C009 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FOXQ1Q9C009 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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