Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB2BQ9BVA1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms