Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NICN1Q9BSH3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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