Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC42Q96M95 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC42Q96M95 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms