Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RABGGTAQ92696 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms