Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP43Q8NFH3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms